第一步  準備兩個比色瓶，皆倒入10ml比對液溶劑(蒸餾水即可)一個為參考比色瓶；另一個使用移液器加入0.4ml有活性的原精液作為測量比色瓶，並對其均勻攪拌。
第二步  開啟精子密度儀，按鍵（ON/OFF），用參考比色瓶（即未添加原精液的溶劑）來對精子密度儀進行歸零按 (ZERO)鍵，即在螢幕上看到（0.0）。
第三步  取出參考比色瓶，放置有精液溶劑的測量比色瓶，通過按鍵（READ/DIRECT）可得到一個數值。
第四步 根據轉換表，將儀器中得到的值與表中相對應，得到濃度的數值，再與我們所用的液體體積相對照，可得出精液中的精子數量。
第五步  精子中可能存在一定數量的非正常形狀的精子（例如：捲起尾巴、細胞質下降、被損壞的），可通過顯微鏡來觀察。
具體操作：
首先使用移液器從帶有精子的溶劑中取出一滴，將它放置在顯微鏡的載玻片中進行觀察，得出非正常形狀的精子數量，用得到的非正常形狀的精子數量，除以取出液體的體積，就能得出非正常形狀的精子濃度，在通過轉換表中的濃度減去非正常形狀的精子濃度，就能得到正常形狀的精子濃度。
把正常形狀的精子濃度和體積相乘就能得到正常形狀的精子數量。